Первое поселение на месте Старого Пафоса возникло еще в период неолита, т.е. позднего каменного века. В настоящее время на месте древнего поселения, расположена деревушка Куклия, это примерно в 12 км от современного города. Согласно археологическим раскопкам, самые ранние из найденных здесь артефактов в виде фигурок и амулетов божеств плодородия датируются 3-м тысячелетием до н. э. Основателем древнего Палеа-Пафоса и его первым царём был финикийский царь Кинир, построивший древний храм Афродиты. Примерно в X веке до н.э. Кипр становится сначала греческой, а потом и финикийской колонией.
В это время площадь Пафоса составляла порядка 100 гектар, город имел оборонительные укрепления, а по периметру был окружен крепостной стеной. Городские кварталы имели четкую прямоугольную планировку и имели свое функциональное назначение – жилые, торговые и административные кварталы. В 58 году до н.э. город попадает под влияние Рима и даже становится резиденцией римского проконсула, а в середине I века н.э. римский проконсул Сергий Павел принимает здесь христианство. В 342 году во время сильнейшего землетрясения городские постройки и инфраструктура города получает колоссальные повреждения и постепенно утрачивает столичные функции, а с начала времен арабских набегов VII—IX веков город и вовсе приходит в упадок.
Эпоха возрождения Пафоса пришлась на время господства Византийской империи. В 965 году Кипр был захвачен и присоединен к Византии, а позднее, в 1191 году к английской империи – в город вошли крестоносцы под командованием короля Ричарда «Львиное Сердце». Через год правителем Кипра стал вассал Ричарда «Львиное Сердце» Ги де Лузиньян, основатель династии Лузиньянов. Оборонительные сооружения города были существенно модернизированы и укреплены. Основным фортификационным сооружением города стала византийская крепость Саранта Колонес, что в переводе означало крепость «сорока колонн». В эпоху Лузиньянов крепость была укреплена и перестроена, однако и это не спасло ее от разрушительного землетрясения 1222 года. Так как повреждения были очень серьезными, восстановлению крепость уже не подлежала, вместо нее был построен новый военных форт меньшего размера, сохранившийся до наших дней.
